在电渗析过程中，通入的电流越大，离子（离子交换设备）迁移的速度越大。但如果电流提高到一定程度后，溶液中所含的离子不能够满足传递电流的需要，会造成在淡水侧发生水分子的电离，产生H⁺和OH^—，由H⁺离子和OH^—离子的迁移来补充传递电流，这种现象称为极化现象。
     极化会导致浓水室膜面结垢。结垢的结果必然造成电流效率的降低，膜的有效面积减小，寿命缩短，影响电渗析过程的正常进行。极化和结垢是影响电渗析工作状况和电渗析稳定运行的重要因素。
     防止极化的方法是控制电渗析器在极限电流密度(膜界面层中产生极化现象时的电流密度，称为极限电流密度)以下运行。
另外，避免结垢的方法还有:
  （1）定期进行倒换电极运行，将膜上积聚的沉淀溶解下来。
  （2）定期酸洗 定期采用1% -2%的盐酸进行清洗，可以去除结在阴膜上的CaCO₃水垢，清洗的周期根据结垢的情况确定，一般为1~4周。
  （3）浓水加酸 由于CaCO₃和Mg (OH)₂的溶度积远远小于CaSO₄和CaC1₂, MgCl₂，采用浓水加酸的办法，使碳酸盐硬度转变成非碳酸盐硬度，可防止碳酸盐硬度水垢的产生，同时防止Mg (OH)₂的析出。一般投加盐酸和硫酸，将浓水的pH调整到4~6为宜。采用浓水加酸的办法还有利于实现浓水循环，可把水的利用率提高到90%以上。
  （4）预软化 原水进入电渗析器之前预先软化，以去除原水中的钙、镁离子，消除结垢的内因。
解体清洗 每半年或一年把电渗析器拆散，解体清洗一次。将膜（反渗透膜）和隔板进行机械清刷和化学酸洗。